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研究建立综合利用DUS性状和SNP指纹的番茄品种精准鉴定新技术
类型：科技成果
发布时间：2023-08-20
来源：北京市农林科学院
近日，我院蔬菜研究所温常龙课题组联合中国农业科学院蔬菜花卉研究所杨坤团队在我院国际期刊《Agriculture Communications》发表题为“Evaluation of SNP fingerprinting for variety identification of tomato by DUS testing”的研究论文。该研究整合了田间DUS表型鉴定和实验室DNA分子指纹检测，为植物新品种保护和品种登记提供了新的鉴定手段，对种子市场监管及种业知识产权保护具有重要意义。
品种鉴定是植物新品种保护和品种登记的重要技术手段，田间DUS表型鉴定和实验室DNA分子指纹检测是目前开展品种鉴定的两种主要方法，但鲜有研究对这两种方法开展系统分析和综合应用。
本研究利用96份番茄种质资源重测序数据筛选出适合品种鉴定的40个SNP位点，然后构建了116份DUS测试品种的SNP指纹，发现SNP鉴定结果与DUS测试结果呈线性相关。其中，每个DUS性状平均与5个性状间存在显著相关，果实性状对番茄品种鉴定结果的贡献率最高，基于两种方法均可将116份番茄分为三个群体，即大果番茄、樱桃番茄和加工番茄。本研究利用PCA分析和核心位点筛选算法，获得18个核心DUS性状和16个核心SNP位点。将来在番茄品种鉴定中，可在苗期快速获得品种的SNP指纹和品种类型，将筛查的近似品种定植于同一小区方便观测表型，从而提高番茄品种鉴定的检测效率和准确度。
